גן החיות התנ"כי ממוקם בצמוד לתחנת הרכבת הנקראת אף היא באותו השם.
גן החיות התנ''כי שוכן כיום בעמק יפהפה בדרום-מערבה של ירושלים, ומשתרע על שטח של 250 דונם לערך.
בגן מערכת של בריכות, אגם גדול ומפלים המקושרים ביניהם. משטחי דשא נרחבים ושפע של פינות חמד מוצלות מקיפים את מקורות המים. האגם מלאכותי ומימיו מטוהרים וממוחזרים. הגן בנוי בשני מפלסים לאורכם נמצאות תצוגות בעלי-החיים, ומסלול התנועה בו מעגלי. בין שני המפלסים מקשרים שבילים ובהם נמצאות תצוגות נוספות.